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2019第四屆PLAGH-MIT醫(yī)療大數(shù)據(jù)Datathon活動圓滿舉行

 2019-11-20 13:52  來源:互聯(lián)網(wǎng)  我來投稿 撤稿糾錯

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"2019中國醫(yī)院協(xié)會醫(yī)學工程專業(yè)委員會學術(shù)年會暨第四屆PLAGH-MIT醫(yī)療大數(shù)據(jù)學術(shù)交流及Datathon活動”,2019年11月14日至17日在北京石景山景園假日酒店舉行。該活動由中國人民*總醫(yī)院聯(lián)合麻省理工學院、哈佛醫(yī)學院、清華大學數(shù)據(jù)科學研究院、《中國醫(yī)療設(shè)備》 雜志社、中國醫(yī)院協(xié)會醫(yī)學工程專業(yè)委員會、北京生理科學院危重癥醫(yī)學專業(yè)委員會共同舉辦,Datahon環(huán)節(jié)引入了和鯨科技和AWS作為技術(shù)支持方,分別提供數(shù)據(jù)科學協(xié)同平臺與云資源支持。

本次Datathon活動分為賽前培訓、課題路演、團隊招募、成果展示和評審頒獎六個環(huán)節(jié),這個過程需要在幾天內(nèi)完成,不僅考驗了每一位參賽隊員的專業(yè)技術(shù)能力,更考驗了每個團隊的協(xié)作配合。

11月15日晚,課題路演正式開始,來自全國各地的隊長紛紛登臺,每個人用120秒的時間針對自己團隊課題進行路演展示,并在現(xiàn)場招募隊員。本屆Datathon課題是臨床方向,隊長大都為臨床醫(yī)生,大量與臨床醫(yī)學密切相關(guān)的課題被提出。由于算法工程師和數(shù)據(jù)科學家的數(shù)量稀缺,他們成為了招募現(xiàn)場的主要對象。

經(jīng)過三個半小時緊張激烈的路演與招募,24個由臨床醫(yī)師、算法工程師、醫(yī)療大數(shù)據(jù)工程師組成的跨領(lǐng)域隊伍集結(jié)完畢,隊員們針對問題作出積極討論,開啟了接下來為期兩天的跨界研究工作。為期兩天的活動時間十分緊張,為了能夠得到有價值的研究成果,各個隊伍的成員們廢寢忘食,毫不懈怠,為了課題進展討論至深夜。

值得一提的是,每屆Datathon活動都會有來自MIT,哈佛醫(yī)學院的國外專家團隊給隊伍提供指導,專家們有著豐富的醫(yī)學及數(shù)據(jù)科研經(jīng)驗,他們把每個參賽小組的課題進行逐個討論,探討題目的可行性、實驗設(shè)計的合理性、研究方向的創(chuàng)新性以及課題與所用數(shù)據(jù)庫的關(guān)聯(lián),并根據(jù)實際情況給出切實可行的建議。

課題初審之后,這些國內(nèi)外的專家還被分配到各個參賽小組,一對一輔導參賽團隊,針對每個團隊的優(yōu)勢和短板提出解決路徑,確保課題方向優(yōu)中選優(yōu),幫助各團隊繞開彎路,提煉靈感,進一步促成高質(zhì)量結(jié)果。這個過程也像一次難得的開放式教育,通過引入國際化專家團隊,幫助參賽者在較短的時間內(nèi)掌握醫(yī)療數(shù)據(jù)科研選題方法和數(shù)據(jù)分析技能。

在課題研究過程中,每一位成員都要或多或少地接觸到數(shù)據(jù)分析,不同角色之間也需要基于數(shù)據(jù)進行協(xié)作,而一個能滿足團隊協(xié)同的數(shù)據(jù)分析工具顯然對研究起到了很大的推動作用,通過和鯨科技的“數(shù)據(jù)科學協(xié)同平臺”K-Lab,讓復(fù)合背景的團隊協(xié)作在Datathon當中得以實現(xiàn),產(chǎn)出基于數(shù)據(jù)科學方法構(gòu)建的研究方案,并更深入地研究和完成最終成果。

經(jīng)過兩天的合力工作,各個團隊最終都產(chǎn)出了自己的研究成果,并以PPT形式進行匯報,來自哈佛、MIT和301醫(yī)院的專家代表團為各個隊伍打分和提出評審意見,評審和打分流程都基于K-Lab平臺進行,除了提交用于展示課題成果的幻燈片之外,每個隊伍還需要基于K-Lab提交數(shù)據(jù)分析所用的代碼,以保證成果可復(fù)現(xiàn)性,12支隊伍最終脫穎而出。

頒獎典禮上,*總醫(yī)院的張政波主任說:“Datathon活動其實不止是一次競賽,更是一個學習交流的過程,大家在這次這個過程中思考、體會,發(fā)現(xiàn)自己的強項和不足,找到互補的團隊和伙伴,推動學科的領(lǐng)域的科學研究,所有人在Datathon中都是贏家。”

活動最終評選出一等獎1項,二等獎3項,三等獎5項,分別由來自北京理工大學、*總醫(yī)院、中山大學附屬第一醫(yī)院、浙江大學醫(yī)學院附屬邵逸夫醫(yī)院、首都醫(yī)科大學等單位的團隊獲得。

一等獎是北京理工大學辛怡教授帶領(lǐng)的團隊,他們研究的題目是根據(jù)ICU患者的生命體征和治療方式預(yù)測血清鈉的水平,因為鈉離子是細胞外液的主要陽離子,血清鈉對維持體內(nèi)電解質(zhì)平衡、酸堿平和和滲透壓皮鞥恒起到關(guān)鍵作用,他們根據(jù)患者生命體征和治療方式的血清鈉建立了機器預(yù)測模型,并根據(jù)這一模型做出了演示APP應(yīng)用。在兩天時間內(nèi),這個成果是驚人的。

作為現(xiàn)場少見的算法出身團隊,獲獎團隊的隊長辛怡教授對表示,這是團隊第三年參與Datathon活動了,第一年參加時是在其它團隊中參與課題,第二年就將自己團隊研究的課題帶到比賽中,得到很多來自MIT和哈佛的教授評委的指點,所以今年團隊將課題再次優(yōu)化,并在現(xiàn)場進行臨床醫(yī)學和醫(yī)學工程隊員招募,將研究進一步落地推進。

“我認為Datathon是一個非常難得的機會,能夠讓學生們接觸到在學校里無法嘗試的完整項目,和整個團隊一起,從提出問題到做出這個問題的解決方案,并且接觸到醫(yī)學背景很強的臨床醫(yī)師,讓科研的深度和廣度都得到提升。所以這次我不僅帶上了我的研究團隊,更帶上了很多我的本科學生來學習觀摩,希望每一位學生都要有一次這樣的體驗。”辛怡教授說。

為期四天的Datathon結(jié)束了,但跨學科的創(chuàng)新協(xié)作卻剛剛開始。據(jù)悉,本次Datathon的成果,將會在進一步細化整理后,以論文形式公開發(fā)表,后續(xù)的合作也將持續(xù)進行。

數(shù)據(jù)科學的發(fā)展,使得醫(yī)療科研在研究方法、運作方式、傳播交流等方面發(fā)生了深刻變革,能夠熟練掌握大數(shù)據(jù)技術(shù)的醫(yī)生,其科研成果也普遍有著更高的行業(yè)影響力。中國目前針對醫(yī)療領(lǐng)域的大數(shù)據(jù)教學,還處于起步階段,Datathon這種能夠促進跨學科人士交流、并提供完備的基礎(chǔ)設(shè)施和數(shù)據(jù)素材進行開放式科研協(xié)作的活動,顯得更加難能可貴。

隨著數(shù)據(jù)的增加,值得科研人員探索的問題也在變多、變難,Datathon的開放科研模式,以數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)與協(xié)作為橋梁,建立起了多學科之間的深入合作,為科研工作的形態(tài)打開了全新的可能。

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